Il clima meraviglioso di Isola del Giglio è mite tutto l’anno e ciò favorisce l’afflusso di turisti che desiderano visitare questo angolo selvaggio del Mar Tirreno. Che sia inverno, primavera, autunno o estate, troverete sempre una esplosione di profumi e fiori che faranno da cornice alle vostre giornate. L'Isola infatti ospita una ricca flora mediterranea, le specie botaniche rinvenute dallo studioso Sommier (1900) sono quasi 700 tra le quali alcune particolarmente rare ed endemiche.

I 2084 gradi giorno registrati ad oltre 400 metri s.l.m. nella frazione di Giglio Castello, ubicata su un poggio nella parte più interna dell'isola, includerebbero l'intero territorio comunale in zona E, fascia climatica che accomuna gran parte dei comuni di aree appenniniche continentali, che però sono caratterizzati da inverni estremamente più rigidi rispetto a quelli gigliesi.

In base ai dati medi disponibili per il trentennio 1951-1980 per l'unica stazione meteorologica situata sull'isola e di seguito riportati, la temperatura media annua si aggira sui +15,1° C ai 160 metri s.l.m. del promontorio del Franco sulla costa occidentale, mentre le precipitazioni medie annue sono molto contenute, facendo segnare nella medesima località appena 402 mm.

Localita: il Franco              
Altitudine: 160 metri s.l.m.                  
Temp. media annua: 15,1 °C             

precip. medie annue: 402 mm    
media di riferimento: 1951-1980

* Classificazione climatica: zona E, 2084 GG
* Diffusività atmosferica: alta, Ibimet CNR 2002
(Fonte Wikipedia)